Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms