Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms