Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TINF2Q9BSI4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms