Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms