Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SUSD3Q96L08 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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