Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCLNQ969V3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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