Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms