Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms