Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms