Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAPD7Q5XG87 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms