Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC073476.3-201ENST00000563949 2507 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms