Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFAP221Q4G0U5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms