Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms