Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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