Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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