Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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LAPTM4AQ15012 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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