Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSPNQ14714 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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