Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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