Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PEX6Q13608 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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