Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K1Q13233 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms