Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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