Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms