Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms