Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms