Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HBBP68871 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HBBP68871 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms