Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms