Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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