Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA4P51532 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms