Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PIK3CBP42338 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms