Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms