Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GGCXP38435 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms