Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms