Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA2P26232 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms