Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms