Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CTSSP25774 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTSSP25774 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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