Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NAP1L6-201ENST00000373518 2044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms