Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRAP18433 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRAP18433 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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