Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLBP06746 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLBP06746 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms