Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGAP02671 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGAP02671 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGAP02671 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGAP02671 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGAP02671 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FGAP02671 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGAP02671 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGAP02671 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms