Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCAP01258 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCAP01258 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCAP01258 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCAP01258 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCAP01258 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms