Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms