Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01387J3KSC0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms