Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPIPB15A6NHN6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPB15A6NHN6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPB15A6NHN6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPB15A6NHN6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPIPB15A6NHN6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPIPB15A6NHN6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.8 ms