Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms