Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX13Q9Y5W8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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