Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C5Q9Y5Q8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C5Q9Y5Q8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms