Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4BQ9Y4P1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4BQ9Y4P1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms