Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED7Q9Y3B3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED7Q9Y3B3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED7Q9Y3B3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms