Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAB39Q9Y376 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAB39Q9Y376 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAB39Q9Y376 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms