Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPK3Q9UPE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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